La discipline « anatomie et cytologie pathologiques » est l'étude des altérations organiques des tissus et des cellules provoquées par la maladie.

Ces altérations sont reconnues par comparaison avec les structures normales.

L'anatomopathologie présente un intérêt majeur pour l'identification des maladies. De nombreuses affections (cancers par exemple) ne peuvent être reconnues avec précision que par l'examen au microscope d'un fragment de la lésion (histopathologie) ou d'un étalement de cellules isolées (cytopathologie). Cette étude apporte également des informations précieuses sur l'extension des lésions par l'examen des pièces opératoires (organes ou tissus prélevés lors d'une intervention), permettant ainsi de choisir le traitement le plus approprié.